东莨菪碱和山莨菪的区别有：

1、天然的提取物不同。山莨菪碱由唐古特莨碱提取，东莨菪碱由洋金花提取。

2、化学结构不同，东莨菪碱为“左旋体”。山莨为“右旋体”或“消旋体”，左旋比右旋体的作用强。

3、在抗M-胆碱受体的作用选择性不同：山莨菪碱与阿托品相似，对腺体、眼、平滑肌及心肌的作用强，但在唾液及扩瞳作用要弱，同时对中枢神经弱。而东莨菪碱主要表现的较强的是“中枢神经”（所以经常用于预防晕车）。

4、东莨作用强，山莨相对较弱。