学校创办于1956年9月，原名为“江苏省南通区、市商业职工学校”；1965年更名为“南通市商业学校”；1978年更名为“江苏省南通供销学校”，由江苏省供销合作总社主管；2003年升格为“江苏省南通商贸高等职业学校”，增挂“江苏联合职业技术学院南通商贸分院”校牌；2013年1月晋升为“江苏商贸职业学院”，隶属于江苏省供销合作总社。

学校占地面积502亩，规划总建筑面积32万平方米。现设有会计与金融、经济与贸易、电子商务与物流、艺术与电子信息、建筑工程与管理等5个二级学院和基础部、继续教育学院；开设的近30个高职专业，基本覆盖了江苏供销合作社及区域现代服务业主要产业和行业；建有物流、商贸、计算机、会计、金融、电子等实训中心，共90个实训室，教学设备总值约6000万元；现有专任教师340人，外籍教师7名，中高级职称占70%以上，“双师型”教师占70%以上；全日制在校学生近8000人。近几年，毕业生就业率一直保持在98%以上，建校以来先后为社会输送了6万多名合格毕业生。