不同的作业系统所使用的档案系统不尽相同，在个人计算机上常用的作业系统中，DOS 6.x及以下版本和Windows 3.x使用FAT16；OS/2使用HPFS；Windows NT则使用NTFS；而MS-DOS7.10/8.0（Windows 95OSR2及Windows 98自带的DOS）及ROM-DOS 7.x同时提供了FAT16及FAT32供用户选用。其中我们接触最多的是FAT16、FAT32档案系统。FAT16在DOS时代得到广泛的套用，一般不常见了。FAT32是FAT16的升级版本，这种格式採用32位的档案分配表，对磁碟的管理能力大大增强，突破了FAT16对每一个分区的容量只有2gb的限制。运用FAT32的分区格式后，用户可以将一个大硬碟定义成一个分区，而不必分为几个分区使用，大大方便了对硬碟的管理工作。而且，FAT32还具有一个最大的优点：在一个不超过8gb的分区中，FAT32分区格式的每个簇容量都固定为4kb，与FAT16相比，可以大大地减少硬碟空间的浪费，提高了硬碟利用效率。虽然在安全性和稳定性上比不上NTFS格式，但它有个最大的优点，那就是兼容性好，几乎所有的作业系统都识别该格式，包括DOS6.0、Win9X、WinNT、Win2000和 WinXP。

Windows95 OSR2和Windows 98开始支持FAT32 档案系统，它是对早期DOS的FAT16档案系统的增强，由于档案系统的核心--档案分配表FAT由16位扩充为32位，所以称为FAT32档案系统。

在一逻辑盘（硬碟的一分区）超过 512兆位元组时使用这种格式，会更高效地存储数据，减少硬碟空间的浪费，一般还会使程式运行加快，使用的计算机系统资源更少，因此是使用大容量硬碟存储档案的极有效的系统。

（一）FAT32 档案系统将逻辑盘的空间划分为三部分，依次是引导区（BOOT区）、档案分配表区（FAT区）、数据区（DATA区）。引导区和档案分配表区又合称为系统区。

（二）引导区只占一个扇区，保存了该逻辑盘每扇区位元组数，每簇对应的扇区数等等重要参数和引导记录。之后还留有31个保留扇区。而FAT16档案系统的引导区只占用一个扇区，没有保留扇区。

（三）档案分配表区共保存了两个相同的档案分配表，因为档案所占用的存储空间（簇链）及空闲空间的管理都是通过FAT实现的，FAT如此重要，保存两个以便第一个损坏时，还有第二个可用。档案系统对数据区的存储空间是按簇进行划分和管理的，簇是空间分配和回收的基本单位，即，一个档案总是占用若干个整簇，档案所使用的最后一簇剩余的空间就不再使用，而是浪费掉了。

从统计学上讲，平均每个档案浪费0.5簇的空间，簇越大，存储档案时空间浪费越多，利用率越低。因此，簇的大小决定了该盘数据区的利用率。FAT16系统簇号用16位二进制数表示，从0002H到FFEFH个可用簇号（FFF0H到FFFFH另有定义，用来表示坏簇，档案结束簇等），允许每一逻辑盘的数据区最多不超过FFEDH（65518）个簇。FAT32系统簇号改用32位二进制数表示，大致从00000002H到FFFFFEFFH个可用簇号。FAT表按顺序依次记录了该盘各簇的使用情况，是一种位示图法。

每簇的使用情况用32位二进制填写，未被分配的簇相应位置写零；坏簇相应位置填入特定值；已分配的簇相应位置填入非零值，具体为：如果该簇是档案的最后一簇，填入的值为FFFFFF0FH，如果该簇不是档案的最后一簇，填入的值为该档案占用的下一个簇的簇号，这样，正好将档案占用的各簇构成一个簇链，保存在FAT表中。00000000H、00000001H两簇号不使用，其对应的两个DWORD位置（FAT表开头的8个位元组）用来存放该盘介质类型编号。FAT表的大小就由该逻辑盘数据区共有多少簇所决定，取整数个扇区。

FAT32系统一簇对应8个逻辑相邻的扇区，理论上，这种用法所能管理的逻辑盘容量上限为16TB（16384GB），容量大于16TB时，可以用一簇对应16个扇区，依此类推。FAT16系统在逻辑盘容量介于128MB到256MB时，一簇对应8个扇区，容量介于256MB到512MB时，一簇对应16个扇区，容量介于512MB到1GB时，一簇对应32个扇区，容量介于1GB到2GB时，一簇对应32个扇区，超出2GB的部分无法使用。显然，对于容量大于512MB的逻辑盘，採用FAT32的簇比採用FAT16的簇小很多，大大减少了空间的浪费。

但是，对于容量小于512MB的盘，採用FAT32虽然一簇8个扇区，比使用FAT16一簇16个扇区，簇有所减小，但FAT32的FAT表较大，占用空间较多，总数据区被减少，两者相抵，实际并不能增加有效存储空间，所以微软建议对小于512M的逻辑盘不使用FAT32。

另外，对于使用FAT16档案系统的用户提一建议，硬碟分区时，不要将分区（逻辑盘）容量正好设为某一区间的下限，例：将一逻辑盘容量设为1100M（稍大于1024M），则使用时其有效存储容量比分区为950M的一般还少，因其簇大一倍，浪费的空间较多。还有，使用FDISK等对分区指定容量时，由于对1MB的定义不一样（标準的二进制的1MB为1048576B，有的系统将1MB理解为1000000B，1000KB等），及每个分区需从新磁轨开始等因素，实际分配的容量可能稍大于指定的容量，亦需注意掌握。

根目录区（ROOT区）不再是固定区域、固定大小，可看作是数据区的一部分。因为根目录已改为根目录档案，採用与子目录档案相同的管理方式，一般情况下从第二簇开始使用，大小视需要增加，因此根目录下的档案数目不再受最多512的限制。FAT16档案系统的根目录区（ROOT区）是固定区域、固定大小的，是从FAT区之后紧接着的32个扇区，最多保存512个目录项，作为系统区的一部分。

目录区中的目录项变化较多，一个目录项仍占32位元组，可以是档案目录项、子目录项、卷标项（仅根目录有）、已删除目录项、长档案名称目录项等。目录项中原来在DOS下保留未用的10个位元组都有了新的定义，全部32位元组的定义如下：

⑴ 0-- 7位元组 档案正名。

⑵ 8--10位元组 档案扩展名。

⑶ 11位元组档案属性，按二进制位定义，最高两位保留未用，0至5位分别是唯读位、隐藏位、系统位、卷标位、子目录位、归档位。

⑷ 11--13位元组 仅长档案名称目录项用，用来存储其对应的短档案名称目录项的档案名称位元组校验和等。

⑸ 13--15位元组 24位二进制的档案建立时间，其中的高5位为小时，次6位为分钟。

⑹ 16--17位元组 16位二进制的档案建立日期，其中的高7位为相对于1980年的年份值，次4位为月份，后5位为月内日期。

⑺ 18--19位元组 16位二进制的档案最新访问日期，定义同⑹。

⑻ 20--21位元组 起始簇号的高16位。

⑼ 22--23位元组 16位二进制的档案最新修改时间，其中的高5位为小时，次6位为分钟，后5位的二倍为秒数。

⑽24--25位元组 16位二进制的档案最新修改日期，定义同⑹。

⑾26--27位元组 起始簇号的低16位。

⑿28--31位元组 32位的档案位元组长度。

其中第⑷至⑻项为以后陆续定义的。对于子目录项，其⑿为零；已删除目录项的首位元组值为E5H。在可以使用长档案名称的FAT32系统中，档案目录项保存该档案的短档案名称，长档案名称用若干个长档案名称目录项保存，长档案名称目录项倒序排在档案短目录项前面，全部是採用双位元组内码保存的，每一项最多保存十三个字元内码，首位元组指明是长档案名称的第几项，11位元组一般为0FH，12位元组指明类型，13位元组为校验和，26--27位元组为零。

以前版本的 Windows 和DOS与 FAT32 不兼容，不能识别FAT32分区，有些程式也依赖于 FAT16 档案系统，不能和 FAT32驱动器一道工作。将硬碟转换为 FAT32，就不能再用双引导运行以前版本的 Windows（Windows 95 [Version 4.00.950]、Windows NT 3.x、Windows NT 4.0和 Windows 3.x）。

要想使用启动盘启动安装，那幺活动分区就必须是FAT格式的，我们可以使用Partition Magic软体进行转换。

启动Partition Magic，在软体主视窗中可以查看到硬碟各个分区的情况。在NTFS分区上点右键，选择“转换”，在弹出的转换分区视窗中的档案系统中选择“FAT32”，最后单击“确定”，重新启动后该分区就成功转换成为FAT32格式的了。

如果你在C糟下安装的Win2000或WinXP採用了默认的NTFS格式，那幺使用Win98启动盘进行启动安装将不能成功，这时你就不得不去了解一下分区格式NTFS和FAT了。

NTFS分区格式是跟随Windows NT系统产生的，它显着的优点是安全性和稳定性极其出色，在使用中不易产生档案碎片，对硬碟的空间利用及软体的运行速度都有好处。它能对用户的操作进行记录，通过对用户许可权进行非常严格的限制，使每个用户只能按照系统赋予的许可权进行操作，充分保护了网路系统与数据的安全。除了Windows NT外，Win 2000和Win XP也都支持这种硬碟分区格式。但因为DOS和Win98是在NTFS格式之前推出的，所以并不能识别NTFS格式。