过往国民政府在港最高级官员为“中国台湾地区外交部驻两广特派员”，办事处称“特派员公署”，地址于九龙油麻地长沙街，此职向外交部部长及广东省政府主席双重负责，在1940年代末期被视为中国政府驻港最高级官员，在1948年九龙城事件时一度拟改为中国驻香港总领事，并将领事馆设在九龙城；因国民政府撤退台湾，以及英国政府承认中华人民共和国政府，使职位在1950年取消。

办事处所处的力宝中心外观

1997年7月1日，“香港事务局”成立，将原有政府驻港机构纳入。香港特别行政区政府就“中华旅行社”发出声明，谓鑒于特区政府并不承认台湾机构之官方地位，故香港事务局只能以非官方身份在港运作，并需要接受某些条件。“中华旅行社总经理”（驻港代表）郑安国在1999年代表台湾政府解释两国论，港台关係受到影响。

2011年7月15日，经台湾当局与香港特别行政区政府密集磋商达成协定后，台湾驻港机构对外名称由“中华旅行社”更名为“台北经济文化办事处”。“中国台湾地区”“台湾行政部门”依《香港澳门关係条例》，核准香港和澳门政府到台湾设立办事机构。香港特别行政区政府于2011年12月在台湾成立“香港经济贸易文化办事处”，为台港两地民众提供服务。