阿川是一家日本料理店的厨师，平时为人相当安静。某天，阿川在厨房工作时，突然倒地失去知觉，同事把他送进医院，观察数天后，却检查不出任何生理上的病因，医生推测阿川或许患有精神疾病。

阿川被送回山上的老家，年老的父亲王伯伯，和已经出嫁的姊姊小芸，在家里等着他，阿川不吃、不语，生活也不能自理，一天半夜，阿川突然起来吃冰柜里的冷饭，隔天，王伯伯从果园回家，不小心踩到了一滩黏稠的东西而摔了一跤，王伯伯起身亮灯，发现小芸躺在血泊中，而阿川则坐在一旁面无表情、瞪大眼睛看着自己。　阿川告诉王伯伯小芸要害他，王伯伯看着面前陌生的儿子问：“你是谁？你不是我儿子”，阿川回答：“我看这身躯空着，就住进来了”，这时，一个叫小吴的警员在门外探头探脑，急促地敲着门，小吴是阿川的国小同学，听说阿川生病回家，便赶来探望他。于是，王伯伯慌乱地把小芸的尸体藏起来后，便打发小吴走。

王伯伯不愿把阿川送进医院，因老伴当年好好的进去之后，就再也没回来了，他只剩阿川一个亲人。王伯伯把小芸的尸体运去山上的农舍小屋，在旁边找了块空地后，便把她埋藏了，这一夜，王伯伯彻夜难眠。

隔天，王伯伯去医院向医生要了些安眠药，并稍微提起阿川的情况，医生把精神病患者称为漂泊的灵魂，并且向王伯伯说精神疾病要靠吃药控制，而药物一般都有副作用。晚上，王伯伯把安眠药加在阿川的饭菜里，趁阿川睡着，把他送到山上小屋里，像个秘密般关了起来。

过了几天，小芸的丈夫来找她，并告诉王伯伯他每次打小芸的电话，另一端总是传来一阵诡异的男性喘息声，王伯伯眼看女婿一步一步接近小屋，突然举起手边的铁锹，往他头上打了下去，接着用挖土机挖了一个大坑，把女婿连车带人送进坑里埋掉，阿川在小屋的门后，静静地目睹了一切。

几天后，小吴带来外地一名警探，向王伯伯询问女儿、女婿失蹤的事，警探问起阿川的事来，王伯伯的刻意维护，却引来警探怀疑，在一阵拉扯下，王伯伯被警探铐在一旁树上，警探则是一步步往小屋前进，突然间，警探却应声倒下，另一名当地警员上前察看时，小屋内又射出另一支金属针状物，刺穿警员的颈动脉，同时，阿川拚命将门踢开，走出小屋。

新闻报导着一名老人向警方投案，说自己杀了四个人，包括自己的女儿、女婿以及两名警员，警方怀疑老人的精神状况异常，案情还在调查中。翌年，阿川到疗养院探望王伯伯，王伯伯忍不住问他：“你到底是谁？”，阿川若无其事地回答：“我是你儿子啊！”。　

《失魂》展现了相当的企图心与视野，是锺孟宏最为成熟的作品，也是华语电影中极少见到的以生存悬问以及人的本质为主题的作品。具有爆发力，勾人屏息，虚实的切换游移亦令人惦念不止。（黄以曦影评）

《失魂》虽以惊悚出招，且招招犀利，但究其实，竟是一部多重变奏的《安魂曲》，其意在安世人之魂――魂兮归来，安心自在。然其用心良苦，如同剧情之悬疑，需要一一参破，方能在虚实之间，清楚照见事物的本质与生命真相。（李鸿文影评）

《失魂》是一部很奇怪的电影。表面看是一部惊悚片，实在是一部励志电影。(台湾影评人评)