在击败巨大的海怪克拉肯之后十年，珀尔修斯，这个宙斯和人类的私生子过着平静的渔民生活。他和自己的家人以及十岁的孩子赫利乌斯生活在一起。可是，珀尔修斯不知道的是，生活中巨大的动荡正在慢慢来临。
因为人类的不忠，奥林匹斯山的诸神们正在慢慢丧失自己不死的特权，而且对于那些关押在地牢里的泰坦神，也渐渐丧失了控制权。宙斯的父亲，曾经被和那些泰坦一起送往地狱最底层的克洛诺斯也正在伺机东山再起，对自己的儿子宙斯发起倒戈一击。在叛变的哈迪斯和宙斯的儿子阿瑞斯的帮助下，克洛诺斯把宙斯绑架到了地狱之中，把他的力量注入到了泰坦神的身上。如果时机成熟，克洛诺斯掌权，那幺他将把这些怪兽全部释放到人间，那个时候人间将变成地狱。
现在，珀尔修斯再也无法坐视不管了，他和安德洛墨达皇后、波塞冬的儿子阿吉诺以及堕落天神赫菲斯托斯一起，来到了地狱，找到了克洛诺斯和那些泰坦神。他们要对黑暗力量发动最后的猛攻，以挽救人类。