玩家同劲敌自合众地方的西侧桧扇市开始旅行，自白露处领取他们的初学者口袋妖怪。与其他口袋妖怪主系列游戏相同，玩家游历整个地区，挑战道馆训练家们以集齐八个道馆徽章，并前往挑战联盟的四天王与冠军。游戏的剧情再次引入了电浆团。电浆团的成员在玩家、劲敌和新任道馆训练家霍米加面前宣布了自己掌控世界的计画并抢走了他人的口袋妖怪。在艾莉丝的督促下，玩家帮助亚堤追蹤电浆团成员，并邂逅了专注于研究神奇宝贝隐藏的力量和才能的阿克罗玛。在不断对抗电浆团并收集道馆徽章的过程中，玩家追蹤电浆团成员来到了最后一个道馆的所在地青海波市，在道馆训练家西子伊的帮助下救出了被电浆团控制的酋雷姆。战斗在青海波市毗邻的巨人洞穴进入了白热化阶段，玩家击败了电浆团首领魁奇思控制的暗黑酋雷姆（黑2）/焰白酋雷姆（白2）。一意孤行的魁奇思无法接受自己再次被挫败（首次发生在黑白中）的事实，没有听从N的劝说离开。后者感谢了玩家一劳永逸地消灭了电浆团。玩家随后挑战了四天王和新任联盟冠军艾莉丝，最终通关。

在游戏的主线剧情完成后，玩家还可以来到N的城堡，了解N的过去。在战胜N后，N会引导玩家收服先前N拥有的传说中的神奇宝贝。

《Fami通》杂誌给予了游戏36/40的总分，略逊于前作《口袋妖怪黑白》。游戏在IGN上收穫得分9.6/10。Audrey Drake高度评价了黑白2，并称游戏的製作远好于之前主系列游戏的同世代重发版本（口袋妖怪黄、口袋妖怪绿宝石、口袋妖怪白金），认为黑白2同黑白相比总体上有不小变化，在同一基础上进行了精炼与改良，加入了大量的新鲜题材。游戏为整个口袋妖怪主系列带来了令人耳目一新的电影般的时刻，达到了DS平台上口袋妖怪的巅峰水平。