Windows 使用“特殊资料夹”的概念来代表保存在计算机中的内容，这使得用户无需再处理绝对档案路径，并且可以在不同系统以及不同应用程式之间修改。这个思想自Windows 95时代便已经开始，在后来每一版本的作业系统中都有将其完善和增加新的功能。

微软的“为Windows而设计”（Designed for Windows）标誌要求程式必须使用特殊资料夹来保存文档和设定。

一个特殊资料夹可以被映射于一个物理地址，或一个“特殊的”资料夹。因此，特殊资料夹与环境变数类似。 事实上，很多在用户层面设定的环境变数是由特殊资料夹的指向来决定的。

然而，特殊资料夹事实上不存在于档案系统中；他们代表了Windows资源管理器中的树形资料夹导航。这与Windows Shell 名字空间类似。在Windows XP系统中，根级的名字空间是桌面，它包含了我的文档，我的电脑，网上邻居和资源回收筒。一些与特殊资料夹相关联的资料夹在物理上也确实存在。Windows资源管理器将特殊资料夹以及它的关联资料夹一併联合起来显示。例如桌面在用户个人资料夹中存在。

在计算机领域，虚拟资料夹（英语：Virtual folder）通常指管理一批档案的一个虚拟的资料夹，它不依赖于目录树层级中的位置，而是由软体将数据存储中的结果合併显示。这可能是一个资料库或自定义索引，然后在资料夹视图中以可视方式呈现它们。虚拟资料夹可以被认为是列出具有特定标记档案的一个视图，在需要时即时将动态内容模拟为一个资料夹并呈现。在计算机科学中有几个相似的理念，包括已保存的搜寻、已保存的查询和过滤等。

虚拟资料夹为用户提供一种更方便方法管理一批内容相关的档案。根据用户所需的特定标準的或所有的档案被聚合到一个虚拟资料夹。虚拟资料夹中的档案不限于硬碟上的某个物理位置，也可能其他形式。事实上，虚拟资料夹中的档案甚至可以并未存储在硬碟上，它们可以是网路共享或自定义套用资料库中的内容，例如邮件或其他资料库。

档案“不能”被存储在虚拟资料夹中，因为那本质上只是一个档案存储的搜寻查询。尝试存储档案到虚拟资料夹可能遇到多种情况，取决于软体实现，档案可能被重定向到某个物理存储空间。

大多数实现都会预先索引硬碟或特定位置上的档案以加速搜寻，这样在搜寻开始时可以查询索引以快速展现和完成搜寻任务，避免等待索引和查询整个资料夹结构。

Windows 资源管理器（Windows Explorer），是Microsoft Windows作业系统中浏览电脑中档案与资料夹结构的基本工具。

打开Windows 资源管理器的视窗称为“浏览”窗格，可以为任何档案进行排序，把地址转成资料夹形式供用户查看，并且列出档案详细数据，或是查看缩略图等；并且用户可以在Windows 资源管理器进行档案移动，将档案从一处移动到另一处，也可以直接更改档案名称称。在任务管理器内名称皆为explorer.exe。