医院有37个临床医疗科室和11个医技科室，同时还有40余个教研室、研究室和实验室。

综合性教学医院，设医疗、医技科室69个。

三级甲等医院

中国医科大学第三临床学院坐落于瀋阳市铁西区滑翔路 39 号。

中国医科大学第四临床学院，综合性三级甲等医院，设有34个临床科室和医剂科室5个，中心实验室1个。

中国医科大学第五临床学院，三级甲等医院，设有内科、外科、妇产科、儿科、五官科、中医科、皮肤科等临床一级学科，下设32个临床二级科室。

中国医科大学第六临床学院（鞍山市中心医院），三级甲等医院。

坐落于抚顺市中央大街。综合性三级甲等医院。

中国医科大学第八临床学院（鞍钢总医院），综合性三级甲等医院。

设心脏内科、影像中心、泌尿外科、心胸外科、骨科、麻醉科、肾脏内科、内分泌内科、神经内科、神经外科、检验科、 ICU 病房等专科。

中国医科大学第九临床学院（本溪市中心医院），综合性三级甲等医院，设有临床科室43个，医技科室24个。

中国医科大学第十临床学院（阜新矿业集团总医院），三级甲等医院。设有临床医技科室40个，下辖分院10家。