14岁时赫南德兹是被水手队兼职球探Luis Fuenmayor发堀，当时在委内瑞拉马拉开波附近有一场棒球比赛。当时发现他投球的时速达94英哩。不过大联盟限制与球员签署契约的年龄，到他年满16岁才签署契约。

在高中毕业后，赫南德兹成为职业棒球选手，而水手队的投标价是71万美元，但是水手队并不是最高价钱的开价者。其他有意与他签署契约的球队包括亚特兰大勇士、纽约洋基及休士顿太空人，其中勇士队提出契约价钱是最高的。

2003年的小联盟球季，赫南德兹取得7胜2败的成绩，冬季时返回委内瑞拉参加冬季联盟比赛。2004年获选为西雅图水手最佳小联盟投手奖。在该年成为MLB明日之星比赛为世界队上阵。2004年曾效力Inland Empire 66ers及圣安东尼奥传教士。他投了149又1/3局、14胜4败、防御率2.9及172次三振。

2005年效力3A联盟的塔科马雨人，取得9胜4败，联盟最佳的2.25防御率，100次三振及88局的投球局数。他被选为太平洋沿岸联盟最佳新人。他曾经受伤一个月，而错过3A联盟的明星赛。

从受伤复原后，赫南德兹立即被水手队登录于球员名单之上。8月4日对底特律老虎的客场比赛中上场。自1984年José Rijo以来，第二年轻在大联盟首次上阵的球员。8月9日，对明尼苏达双城比赛取得首场大联盟胜投，他投了8局完封的比赛。

赫南德兹在该球季出赛12场，成绩是4胜4败、77个三振、4.52防御率、投了84又1/3局。后来被委内瑞拉队参加世界棒球经典赛，不过水手队拒绝让他参与比赛。球季结束后，他的背号由59号改为34号。

赫南德兹在春季集训期间，出现外胫痛，不过仍赶在球季开始前恢复伤势。2006年6月11日对洛杉矶天使队比赛，投出第一场完投，最后以6:2击败对手。8月28日，赫南德兹对天使队投出球季首次完封。

水手队为避免年轻的他受伤，限制在球季的投球局数及每场比赛的投球次数，包括春季集训，他只能投200局比赛（后来更改为205局╕，因此该季预定最后一场让赫南德兹登场的比赛也被迫由其他投手代替。

由于赫南德兹在春季集训有好表现，由此球队决定不再限制他的投球局数。他更成为水手到的球季第一场的开幕投手。最后协助球队以4-0击败奥克兰运动家。4月11日客场与波士顿红袜队交战，对手是松坂大辅，最后仅被对手击出一支安打，以3-0击败红袜队，完成了季内第一场完封比赛。

5月15日赫南德兹被登录为伤兵名单。并在6月21日对匹兹堡海盗队的比赛中伤愈复出，并投出八局的完封，没有被对手拿下任何分数。虽然水手队在该球季有机会晋身季后赛，可是球队季末表现一般。9月3日虽然在对纽约洋基队的比赛中上阵，并击败对手，阻止九连败。但是季末水手队还是丧失季后赛的资格。赫南德兹2007年的总成绩为14胜7败，3.92防御率及165个三振。

4月16日，赫南德兹对奥克兰运动家造出大联盟生涯中第一次完投，协助球队以4-2击败对手。

6月17日，赫南德兹对佛罗里达马林鱼，在一局中以乾净俐落的9颗球三振三名打者。

6月23日对纽约大都会的跨联盟比赛中，从尤汉·山塔纳击出大联盟生涯第一支本垒打，还是发满贯炮。

西雅图水手队与赫南德兹于1月21日签订5年共七千八百万美元之和约。水手队并于季后透过交易取得2008年美联赛扬奖得主克里夫·李与赫南德兹组成左右王牌。 6月3日赫南德兹在主场出战明尼苏达双城时在第八局中单局三振了四名打者，赫南德兹为西雅图水手队第四位达成此成就的选手。。 8月25日赫南德兹在客场出战波士顿红袜，在第6局时三振了大卫·欧提兹并达成生涯第一千次的三振，其中赫南德兹为1952年后第三年轻之选手达成此成就。。 赫南德兹于9月17日对上德州游骑兵时挑战无安打比赛，直到第八局时尼尔森·克鲁斯的本垒打成为游骑兵第一支安打。。赫南德兹在9月23日于客场出战多伦多蓝鸟并缴出仅2安打的完投佳绩，其中只被荷西·鲍帝斯塔的阳春弹攻下一分，该支本垒打为荷西·鲍帝斯塔本季第50轰，然而西雅图水手队亦遭到蓝鸟队的投手接力完封，最终赫南德兹于此役取得了本季第12败。。

赫南德兹在以13胜12败，防御率2.27的及投出232次三振的成绩夺得美国联盟赛扬奖，其中13胜为历届赛扬奖得主中最少。。

赫南德兹于8月15日对上坦帕湾光芒投出生涯首次完全比赛，成为大联盟史上第23位投出完全比赛的投手，在赛事中12次三振对方。

赫南德兹代表委内瑞拉在2009年世界棒球经典赛登板。对波多黎各的比赛中，投4.2局无失分。