清顺治二年（1645），清廷改南京（南直隶）为江南省，辖区大致包括今江苏省、安徽省和上海市。设左、右布政使于江宁（今南京），左为长，右为副，掌全省政令、财赋。衙署在大功坊，即今瞻园路128号。

顺治十八年（1661），右布政使移驻苏州，领江宁等5府，辖苏南及上海市一带；左布政使仍驻江宁，领淮安等9府，辖今苏北及安徽省一带。

康熙六年（1667），江南省分为安徽、江苏两省，左、右布政使相应改为安徽、江苏布政使，驻地不变。

乾隆二十五年（1760）八月，安徽布政使移驻安庆、新设江宁布政使于江宁、辖江宁、淮安、扬州、徐州、海州、通州等府州。全国18个直省，惟江苏省分设两布政使（江宁、江苏）。衙署仍在大功坊。布政使为从二品。凡诸政务会同督抚议行，乾隆以后实际成为督抚属官。属员有经历司经历、都事，掌出纳文移；照磨所照摩，掌处理案卷；理问所理部，掌推勘刑名；库大使，掌库藏籍账；仓大使，掌稽仓储。