水陆联运收人的核算是指对水陆联运收入的帐务处理。水陆联运指货物从起运地到目的地全程运输由航运企业和铁路局联合完成。

如鞍山经铁路到大连，经海运到上海，又经铁路到杭州。水陆联运运杂费的收款方式，有“起收”和“到收”两种。属于一次收清全程运杂费的联运货物（煤、生铁、钢及钢铁材料、金属矿石、非金属矿石、水泥、化学肥料、粮食和盐等九大类整车物资），一律由水路起运港或铁路起运站一次“起收”（一般不收目的地的杂费）。水路和铁路间的清算在第一换装地点清算。不属于一次收清全程运杂费的联运货物（即零担或非九大类物资），由水路和铁路按下列办法分别收取运杂费：（1）从水路起运到达铁路时（即水—铁），水路段的运杂费，由起运港“起收”，铁路段的运杂费由目的站“到收”。从铁路起运到达水路时（即铁——水），则铁路“起收”，水路“到收”。（2)从水路起运经过铁路又到达水路时（即水——铁——水)，水路的前段、后段运费均由起运港“起收”，中段的铁路运杂费，由铁路接运的第一换装站将铁路段的运杂费、填入联运票据内，加盖车站日戳，由目的港向收货人核收。从铁路起运经过水路又到达铁路时（即铁水——铁），铁路的前段、后段运杂费均由起运站起收；中段的水路运杂费，由水路接运的第一换装港将水路区段的运杂费填入联运票据内，加盖港口日戳，由目的站向收货人核收。水路和铁路对不属于一次收清全程运杂费的清算，在最后换装地点清算。

水铁联运，从甲港起运，经水运到乙港，换乘铁路运输到丙港并一次收清全程费用。甲港向发货人收款，计入本港收入和代收的水、铁运费和换装费时，借记“进款往来”科目，贷记“装卸收入”、“联运及代理往来—一海运企业”科目。海运企业根据甲港报送的“营运收支日报”及所附单据，计入本企业营运收入和暂收的后段运费、换装费时，借记“联运及代理往来——甲港”科目，贷记“运输收入”、“联运及代理往来—乙港”科目。乙港根据运单，向海运企业扣收本港换装收入和锣路运费时，借记“联运及代理往来—海运企业”科目，贷记“装卸收入”、“联运及代理往来—铁路运输企业”科目。若水一铁一水联运，从甲港起运，经水路到乙港，换装铁路到丙港，又经水路到丁港，一次收清全程运杂费。起运港甲港向发货人收取全程运杂费（不含丁港）。乙港根据运单，向海运企业扣收本港换装费收入和以后各段水、铁运杂费时，借记“联运及代理往来——海运企业”科目，贷记“装卸收入”、“联运及代理往来——丙港”、“联运及代理往来——铁路运输企业”科目。丙港根据运单，向乙港扣收本港换装费收入和次段运费时，借记“联运及代理往来—乙港”科目，贷记“装卸收入”、“联运及代理往来——内河企业”科目。