2013年，武汉市开始启动武汉新港空港综合保税区申报工作，当年12月省政府向国务院递交《关于恳请设立武汉新港空港综合保税区的请示》。截至2016年1月，已获国家11个部委会签通过，并已呈报国务院。

武汉新港空港综合保税区于2016年3月11日获国务院正式批准设立，规划面积4.05平方公里。

武汉新港空港综合保税区总规划面积4.05平方公里，拟採用“一区两园”的模式，包括依託阳逻港设定阳逻港园区（1平方公里）和依託武汉东西湖保税物流中心设定东西湖园区（3.05平方公里）。

经过1年建设，该综保区一期验收面积已建成1.5035平方公里（占总规划面积的37.1%），其中阳逻港园区验收面积0.6798平方公里，东西湖园区验收面积0.8237平方公里。

2017年8月，湖北第二座综合保税区武汉新港空港综合保税区封关运营。

阳逻港园区毗邻阳逻港货柜作业区，东西湖园区坐拥中欧（武汉）班列起点站、靠近武汉天河机场，两大园区均可实现港区联动。下一步，综保区将依託三大国际物流通道，对接“一带一路”“长江经济带”，发展保税加工、保税物流、保税服务等业务，发挥肉类口岸、粮食口岸、水果口岸、汽车整车进口口岸等口岸功能，为湖北、武汉构建新的开放高地提供重要平台。