由于改革开放和国民经济发展的需要，其内设机构不断调整，时有分合、增减。1997年12月，根据市机构编制委员会审定，市计委内设机构为：办公室、市政府工作目标管理办公室（综合处）、长期规划处、国土处（挂市政府国土整治办公室牌子）、固定资产投资处、产业政策处、科学技术处、基本建设管理处（挂武汉市重点项目建设办公室牌子）、外经外贸处、财政金融经济调节处（挂市全社会资金监测和调控领导小组办公室牌子）、能源交通处、第三产业规划协调办公室、工业经济处、商品流通处、农村经济处、社会事业处、劳动工资和社会保障处（挂市控制人口机械增长管理小组办公室牌子）等17个职能处室以及机关党委和离退休干部处。另外，武汉市支援三峡工程建设委员会办公室挂靠市计委。全委机关行政编制100名。