主要研究水环境生态（近海、河口和淡水生态学）与浮游动物生态学、渔业水域环境生态学与生物修复技术等。90年代以来，分别在奥地利科学院湖沼学研究所和英国水生态研究所爱丁堡实验室学习和工作1年半。曾前往奥地利、俄罗斯、英国、美国、葡萄牙等国参加国际学术交流。

近年主持和参加的主要科研项目：富营养化海水养殖区大型海藻栽培的生物修复效应（中韩科技合作项目，中方负责人）；河口—近海环境污染调控对策及生态系统变异的趋势预测（科技部973项目，主要骨干）；典型海湾与湖泊富营养化及其生态系统回响与治理对策的研究（中国科学院知识创新工程项目，课题负责人之一）；中国陆地与近海生态系统碳收支研究（中国科学院知识创新工程项目，子课题负责人之一）；典型海湾生态系统动态过程与持续发展研究（国家基金重点基金）；亚热带典型海湾生态系统最佳化示範模式与生产力可持续性研究（中国科学院九五特别支持项目）；江汉平原典型湖泊渔业生态系统最佳化结构的研究（国家自然科学基金重点基金）；苏格兰Leven湖浮游动物生态学研究（Scottish Natural Heritage基金）；东湖生态系统结构、功能及最佳化模式研究（中国科学院生态系统研究网路重点课题）。