据嘉庆庚申《兰溪县誌》卷九中记载：净土庵，东门外，严崇善建，今改梵音禅寺。
这是兰溪地方志上最原始的记载，总共16字。寺内现存清嘉庆十八年(1838年)修寺功德碑一通，印证此寺在当年的扩建盛况。

民国初期，该寺被誉为“东南第一山”，成为浙中着名的佛教活动场所。释印觉法师驻锡此寺后，寺庙建设得到了发展，成为目前兰溪佛教界的联络中心。寺前有座石牌楼，牌榜“梵音寺”三字由现代佛教泰斗、中国佛教协会原会长本焕长老在九十二岁时亲笔题写。

解放后，寺产归生产队，寺内两边客堂分给了当地农户。因地藏殿、大雄宝殿改作生产队粮库，得以保存。两名僧人茂良、茂江作为生产队的五保户，住在寺内帮助看管粮库，得到赡养。均在90多岁时圆寂。

经清光绪年间和民国六年两次扩建，民国年间梵音寺已有山门、天王殿、大雄宝殿、法堂，共五进。两边还有客堂、斋堂、客房、库房等附属建筑。另据现保存的《梵音寺产》碑记记载，当时寺院还有寺产，计田17亩、地4亩、山8亩、塘6分，可见已是一座具有相当规模的佛寺了。
梵音寺历史上一直以信仰地藏为主，每年农曆七月有庙会，当时有兰溪本地以及金华、建德等周边地县香客前来朝拜。
解放后，因地藏殿、大雄宝殿改作生产队粮库，得以保存。两名僧人茂良、茂江作为生产队的五保户，住在寺内帮助看管粮库，得到赡养。均在90多岁时圆寂。
改革开放后，梵音寺开始修复。1997年12月，经市有关部门批准，成为对外开放场所。1998年11月，释印觉任住持，全面修复寺院。2002年，以修旧如旧的办法复建地藏殿。2005年新建了一座观音殿。2010年建成了斋堂、客房、法堂。如今，梵音寺已成为面积达5000平方米的一所功能齐全的中等寺院。多年来，每年农曆正月和七月，有来自上海、杭州、温州等地众多信徒前来朝拜，盛况空前。
梵音寺内现塑有一堂十殿阎王像。这堂阎王摈弃了面目狰狞的旧规，塑得形象端庄，平易近人，富有创意。
梵音寺内除了传承地藏文化之外，还着力弘扬罗汉文化。寺中有一组十八罗汉像，由浙江省美术家协会会员黄金铨创作，每幅画像上均由浙江省书法家协会会员王渊题字，字画珠联璧合，也是梵音寺文化的一个亮点。