1983年，教育部批准成立海南大学水产养殖专业；同年，海南大学成立水产养殖专业筹备组。

1988年，成立海南大学水产系。

1990年，海南大学水产系併入海南大学农学院，为农学院水产系。

2002年7月，海南大学海洋学院在原海南大学农学院水产系的基础上成立。

2003年，获批建设“海南省热带水生生物技术重点实验室”。

2005年，获批建设“热带生物资源教育部重点实验室”。

2007年，学院被评为“海南省教育系统先进集体”。

2009年，“海洋生物实验教学示範中心”获批为国家级实验教学示範中心。

2011年，“热带特色海洋药物芋螺毒素资源的研究与利用”入选教育部“长江学者和创新团队发展计画”创新团队。

2012年，“热带水产健康养殖与病害控制创新团队”入选农业部“农业科研杰出人才及其创新团队”。

2014年，热带水产健康养殖学科组被授予“全国专业技术人才先进集体”称号。

2016年，与海南大学其他学科组建获批“南海海洋资源利用国家重点实验室”。

截至2019年6月，学院有海洋科学、海洋资源与环境、水产养殖学3个本科专业。

截至2019年5月，学院拥有学术学位一级学科博士点1个、学术学位一级学科硕士点1个、学术学位二级学科硕士点1个、硕士专业学位授权类别1个、省特色重点学科2个。

学术学位一级学科博士点：水生生物学

学术学位一级学科硕士点：水产学

学术学位二级学科硕士点：海洋生物学

硕士专业学位授权类别：农业推广（渔业）

海南省特色重点学科：水产学科

截至2019年5月，学院有教职工57名，其中教学人员43名。在教学人员中，正高职称教师25名、副高职称教师27名，具有博士学位50名；有长江学者特聘教授1名、科技部中青年科技创新领军人才1名、国家“万人计画”领军人才1名、新世纪“百千万人才工程”国家级人选2名、全国杰出专业技术人才和全国农业科研杰出人才各1名、国务院特贴专家5名、海南省有突出贡献的优秀中青年专家3名、海南省高层次创新创业人才1名；有全国先进工作者1名、全国优秀教师3名、全国三八红旗手1名、全国优秀知识女性1名、海南省教学名师1名；此外，学院聘请林浩然院士为双聘院士，聘请中国国内外一批专家为特聘教授、客座教授和兼职教授等。

中国工程院院士：林浩然（双聘）

国家“万人计画”领军人才、全国杰出专业技术人才、科技部中青年科技创新领军人才、教育部长江学者特聘教授、全国三八红旗手：罗素兰

新世纪“百千万人才工程”国家级人选：周永灿、罗素兰

海南省教学名师、全国农业科研杰出人才:周永灿

全国先进工作者：赖秋明

享受国务院政府特殊津贴专家：张本、罗素兰、冯永勤、陈国华、周永灿

全国优秀教师：王爱民、周永灿

海南省“515”人才工程人选：张英霞、郭志强

海南省高层次创新创业人才：郭志强

海南省有突出贡献的优秀中青年专家：周永灿、胡新文、罗素兰

截至2019年5月，学院有省级精品课程2项、国家级实验教学示範中心1个。

国家级实验教学示範中心：海洋生物国家级实验教学示範中心

省级精品课程：鱼类学、海水养殖动物病害学

截至2018年11月，学院设有热带生物资源教育部重点实验室、海南省热带水生生物技术重点实验室、海南-东协热带海洋生物科技合作基地等教学科研平台。

截至2019年5月，近5年来，新增各类科研项目232项，其中国家级项目47项、省部级项目90项，科研总经费11166.6万元，人均科研经费位居全校之首；获海南省科技进步一等奖等省部级科研奖励5项，获得授权专利44项，获国家级新品种1个；编着出版专着36部；发表学术论文462篇，其中SCI收录论文188篇；完成了“波纹唇鱼人工繁殖技术研究”、“驼背鲈健康高效工厂化养殖技术”、“点带石斑鱼规模化人工繁育技术研究”等一批达到国际领先或国际先进水平的科研成果，马氏珠母贝“海优1号”等多项成果套用于生产。

海洋学院组织了大学生艺术竞赛、“海之宣言”中文演讲比赛、“爱寝海”寝室文化节、趣味篮球赛、知识问答竞赛活动、帮扶活动、中文辩论赛、志愿服务活动等学生文化活动。