(一)贯彻执行出入境卫生检疫、动植物检疫和进出口商品检验法律、法规、政策规定的办法及工作规程；负责所辖区域的出入境检验检疫、鉴定、认证的监督管理等行政执法工作。

(二)负责实施出入境卫生检疫、传染病监测和卫生监督；负责口岸传染病的预防与控制工作；负责出入境人员的预防接种传染病监测体检的管理工作。

(三)负责实施出入境动植物及其产品和其他检疫物的检验检疫与监督管理；负责动植物疫情监测、调查等工作，办理上级授权的动植物检疫审批，实施动植物疫情的紧急预防措施。

(四)负责实施出入境商品（含食品）的法定检验和监督管理；负责实施一般包装和出口危险品货物包装检验；负责出入境商品鉴定管理工作；负责实施外商投资财产鉴定工作。

(五)负责实施对出入境食品、动植物及其产品等的生产（养殖、种植）、加工和存放等单位的卫生、检疫注册；负责实施进口安全质量许可和出口质量许可工作；负责实施出入境产品、体系认证和实验室认可、人员注册等工作，并监督管理。

(六)负责实施国家实行的进口制度和民用商品的入境验证；负责出口、转口商品的有关出境验证；负责出入境人员携运的商业性货物的检验和监督管理。

(七)负责实施出入境交通工具和货柜及容器的卫生监督、检疫监督和有关的适载检验、鉴定；负责出入境交通运载工具、货柜、包装物及垫材料和货物的卫生除害处理的管理工作。

(八)负责执行国务院的关部门和国家出入境检验检疫局签署的有关检验检疫的国际协定的实施工作。

(九)负责签发出入境检验检疫证单，签证和标识封识，并进行监督管理；负责出口商品普惠制原产地证和一般原产地证的签证工作。

(十)负责对所辖区域的出入境检验检疫业务统计，调查和收集国外传染病疫情、动植物疫情和国际贸易商品质量状况，提供有关信息。

(十一)负责对所辖区域内各类涉外检验检疫、鉴定和认证机构（包括中外合资、合作机构）以及卫生除害处理机构的监督管理。

(十二)负责出入境检验检疫科技、标準化和信息工作；负责有关的国际合作与交流工作。

(十三）承办上级交办的其他工作。

(一)办公室

协调全局日常工作，组织会议，起草档案；负责文秘、机要、档案、保密、政务信息、接待和宣传工作；负责党务、思想政治工作和精神文明建设；负责人事、监察、劳动工资、教育培训、安全保卫和离退休职工管理等工作；负责财务计画、财会工作及国有资产管理。

(二)综合科

负责科技、标準化工作，仪器设备、实验室管理，承办并协调出入境卫生、检疫注册、登记和安全质量许可、出口质量许可、质量认证工作；负责检验检疫业务协调和统计分析；负责鉴定业务管理；负责出入境检验检疫证书证单的签发工作；负责检验检疫报检、计收费、签证、放行、证单及流程管理；负责出入境商品的封识、标籤、批次管理和入境邮寄物检疫；负责普惠制原产地证书和一般原产地证书的签发与监督管理。

(三)口岸查验监管科

负责同江口岸出入境人员卫生检疫、动植物检疫和监督管理工作；负责出境商品查验换证、入境商品登记放行工作；负责对出入境人员携运的商业性货物实施检验和监督管理；负责有关检验检疫法制工作及执法督查、稽查工作。

(四)卫生检疫科

负责出入境卫生检疫、传染病监测和口岸卫生监督，收集国内外有关传染病疫情信息；负责传染病检测体检与预防接种的管理工作；承办卫生检疫注册和卫生检疫特殊物品的报批工作。

(五)动植物检验检疫科

负责出入境动植物及其产品和其他应检的检疫和监督管理；承办授权的入境动植物检疫及其产品审批，收集动植物疫情信息；承办出入境动植物及其产品的检疫和卫生注册和考核与监督检查；负责出入境食品等商品的法定检验和监督管理；承办出入境食品等商品卫生注册的考核和监督检查。

(六)工业品检验科

负责出入境工业等商品的法定检验和监督管理；负责一般包装、出口危险品包装检验和包装许可的考核监督检查；负责外商投资财产鉴定工作；负责进出口商品安全质量许可的实施。出口商品质量许可的考核与监督检查。