安徽大学徽文化传承与创新中心以安徽大学为牵头单位，联合国内徽文化研究、保护和传承的主要单位南京大学、中国社会科学院、安徽省委宣传部、安徽省文化厅、安徽省社会科学院、安徽省文物局、黄山市人民政府、合肥工业大学、黄山学院、安徽中医药大学、安徽建筑大学、黄山中国徽州文化博物馆、黄山市文化产业投资有限责任公司等，共建“徽文化传承与创新中心”，搭建“徽文化基础研究中心”、“徽州文化遗产保护与利用研究中心”、“徽派建筑文化研究中心”、“新安医学与文化研究中心”、“徽文化产业开发研究中心”等五大平台。
牵头单位安徽大学出台了有关协同创新中心建设的系列档案和制度，主要为中心提供驻所、办公和研究设备及其他必要支持，对中心实行政策倾斜，使其成为相对独立的实体，支持中心开展科研体制机制和研究生教育体制改革。高校参建单位主要依据学科特色和人才优势，从事徽文化的形态研究、传播与产业化研究，培养徽文化传承创新人才；政府参建单位主要承担徽文化传承保护工作，推动徽文化产业化进程，给予协同创新体政策和智力支持。协同创新体已汇聚徽学等4个教育部研究中心和汉语言文字等2个国家级重点学科，近年获得约9000余万元研究经费，形成了近60人的专门人才队伍。
安徽大学徽文化传承与创新中心设立理事会、中心委员会和科学谘询委员会等决策管理层。理事会主要由牵头单位和相关参与、支持单位组成，选举理事长1人、副理事长2人、理事若干人；中心委员会设主任1人、副主任3人、秘书长1人；设立科学谘询委员会，设科学谘询委员会主任1人、副主任2人、委员若干人。
安徽大学徽文化传承与创新中心设立“科学研究与产业开发部”、“行政外联部”等管理和服务部门。