迷路的少年，幽灵的少女，在充满传言的旧校舍结下了姻缘，一起去寻找迷失在校园某处的少女身体，然而他们得到的却是一丝不挂的答案。然而谜团并没有终结，探寻真相的普通少年和幽灵少女再一次站在了一起，等待他们的究竟是如何的未来……
以创立60年的传统而自豪的私立诚教学园，建立在一座小山上俯瞰着整个城市，不过，学园创立以来，以“旧校舍的幽灵”为首的各式各样鬼怪故事和城市传说在学生之间流传。
有一天，在校生新谷贞一遇见穿着现在已被停用的黑水手服的不可思议的女学生。那位女学生称自己正是“旧校舍的幽灵”夕子，并希望贞一协助她找出自己的死因与真相。

旧校舍的幽灵
幽灵
捉迷藏
神隐
诅咒石
小红人
江户时代)的活人献祭传说中神明的使者之名。
那时人们相信土地上的灾害是土地神愤怒的表现，而这块土地为了平息神的愤怒，便会从村民中选出一位“铜人”，再由小红人指定一名村民作为祭品献给神明。
叙述了影夕子的由来。（仅见于动画版）
异次元十三层阶梯异次元十三阶段
学校七大不可思议之一。
传说内容为整个校园内仅有一处有13阶的阶梯，而最后的梯层就是通往异次元的入口，只要误踩其中就永远无法回来。
为藏匿在被称“监狱”的废弃校舍中3楼秘密隔间的楼梯，一共13层梯阶，面前有一道门，而门通往的地方是：没有，也就是说一打开门就会面临3楼层高的临际，一不注意就会摔下去，符合“一般”怪谈的内容。
真实的内容为楼梯的转折处旁有道隐藏的玄关，楼梯紧接通往的是陈列许多旧饰的小房间。
实际为摆放夕子遗物的地方。
七大不思议的诅咒七不思议の咒い
据悉一旦知道了七大不可思议的实质内容，就会因诅咒而亡。实际情况目前有过于草率，有待调查。

放学后的骚灵现象
怨念的自动电梯
营养午餐的电梯夹断，因其怨恨而使自动电梯继续运转，据传被其诱惑的学生，会诱入电梯内并送往异界。
叫住之窗呼び止め窗（よびとめまど）
下课后，经过某扇窗户时会被除了自己以外谁也听不见的声音叫住，只要在那个时候抬头仰望那扇窗户，就会与怪谈中出现的女子四眼互视。
怪谈源自校内的第四校舍，生前遭到虐待，所以只要与她四眼相对的人三天后都会在第四校舍跳楼自杀。
六年樱六年桜（ろくねんざくら）
曾经有对要好的女学生，因注定的别离而打算在毕业前夕双双自我了结性命，之后在那个地方种了棵樱花树，每隔六年总会有不堪离别之痛的学生在此树下丧命
归来的夕子小姐かえってきたゆうこさん
起源是一位名字念法相同的女学生，因为遭受欺负所引起的报复。
理化教室的人体模型こころない人体模型（こころないじんたいもけい）
位于旧校舍的理化教室的人体模型，为了寻找缺失的心脏而在深夜里的校园四处徘徊着，据传还有工友因此而整颗心脏被挖走，隔天早上只留下没有心的尸体。
没有心隐含了“没有心脏”和“缺乏人心的残酷”两种意义。
最后那颗心脏在怪事调查社发现，原来是夕子带回来的..。
六点的哭声ろくじになく声
一旦听说过这个怪谈，将会不久人世，而唯一解除的方式就是转述给其他人。不过到目前为止只知晓其名，从没人清楚怪谈的内容。实际上只是第三新闻社玩笑用的传统。
黑暗绘画
传闻为尘封在美术室仓库，一张由幽灵所画下的图画所作的俗称，据传看过画的人就会开始在现实中看得见那位被描绘的幽灵的身影。

旧校舍
根据第一集最后的补充，可以一窥整个诚教学园，旧校舍则是位在这个校园中最里面偏近山上的地方，而调查社则是校舍侧边的一楼处。
怪事调查社　怪异调查部
根据第一集最后的补充，看见整个调查社内部，原先是个很少人经过的储藏室，被夕子打理过后还算满棒的，不过还未被学校认可。
第三新闻社
小此木所担任的社团，社长佐原自称是从“花园的最新情报到小鸡的极密信息”都无所不包的社团。
四方山八百万新闻　四方山八百万新闻（よもやまやおよろずしんぶん）
第三新闻社发行的刊物，可以在单行本最末页看见，会发行一些校内小轶事，以及“好吃到爆”的水果销售面，另外还小小的帮助怪事调查社做点宣传。
有趣的是第一刷的单行本第一集可以看到印错的年代(2010年（平成22年）)，应该是平成21年。
监狱校舍
校舍扩建时期因柱子包围着看起来像监狱的而衍生的戏称，现已废弃使用，同时也是三原瞧见幽灵的地点。