麻椒鱼虽然十分好吃，但是在制作和使用时是有一些需要注意的。在食用鱼类时，一定要挑选含汞量少、受污染比较轻的鱼，一般来说体型越小的鱼汞含量能更少一些；另外需要注意的是在制作鱼肉时一定要做熟，没有熟的鱼中可能会含有寄生虫，不要把生的鱼和熟的放在一起，避免交叉感染寄生虫。