糖桂花的储存如老酒，只要保存得当，时间越久越香浓。一般来说，自家酿制的糖桂花可以保存一至两年。放在冰箱中更可以保存三至四年不变质。

糖桂花的保存要防止阳光直射，尽可能放在阴凉避光的地方，每次取用时最好使用干净的器具，食用完毕后立即将盖紧并放入冰箱。如果闻到糖桂花已经产生异味或者发酸，最好不要食用了。